Dưới sự tài trợ của Tập đoàn T&T, câu lạc bộ Hà Nội – T&T thành lập vào ngày 18 tháng 6 năm 2006. 03 mùa giải đầu tiên, từ một đội bóng gồm đa số các cầu thủ trẻ do huấn luyện viên Triệu Quang Hà (cựu cầu thủ đội tuyển bóng đá Việt Nam và câu lạc bộ Thể Công) dẫn dắt đã liên tiếp thăng ba hạng, từ hạng Ba lên hạng chuyên nghiệp, giành quyền thi đấu ở đấu trường danh giá nhất Việt Nam V-League 2009.